2025年10月，财政部印发《行政事业单位内部控制评价办法》，我国行政事业单位内部控制工作进入了“系统评价与结果应用”的新阶段。文章通过制度对比分析，剖析文件在立法依据与定位、责任体系、评价体系、结果应用与监督协同5个维度的核心革新，揭示其推动公立医院内部控制评价从“形式合规”向“实质治理”转变的治理趋势。分析表明，现行公立医院内部控制评价体系在目标、机制与能力方面存在适配短板，难以匹配刚性的治理要求。基于此，文章构建了“合规、效能、公益”为导向的“目标—框架—机制—能力”四位一体的内控评价优化路径，为公立医院落实制度要求，推动财会监督深度融入医院治理并实现高质量发展提供实践参考。